839年秋,在太常卿任上的崔郸被授与同中书门下平章事,现实上相称于宰相。随后他又任中书侍郎,授银青光禄年夜夫荣衔。840年,文宗驾崩,弟唐武宗继位,宰相杨嗣复、李珏被罢撤,李德裕被录用为首席宰相,而崔郸的宰相位置稳定,听说李德裕跟崔氏兄弟有临时的友爱。841年,武宗认定杨嗣复、李珏不盼望本人继位,想处决他们。李德裕在杜悰倡议下,跟崔郸及其余宰相陈夷行、崔珙一起参与,武宗饶过了杨、李的生命,改成放逐到距都城很远的处所。
841岁终,崔郸分开长安,任西川节度使。武宗的叔父唐宣宗继位后,任他为淮南(首府在今扬州)节度使,授同中书门下平章事。他卒于淮南任上,薨年不详。